Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT1P21579 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT1P21579 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT1P21579 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT1P21579 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT1P21579 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT1P21579 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT1P21579 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT1P21579 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT1P21579 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYT1P21579 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT1P21579 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT1P21579 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT1P21579 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT1P21579 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT1P21579 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT1P21579 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT1P21579 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT1P21579 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT1P21579 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT1P21579 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYT1P21579 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT1P21579 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT1P21579 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT1P21579 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT1P21579 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT1P21579 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT1P21579 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT1P21579 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT1P21579 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT1P21579 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT1P21579 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT1P21579 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT1P21579 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT1P21579 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT1P21579 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT1P21579 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYT1P21579 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT1P21579 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT1P21579 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT1P21579 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT1P21579 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT1P21579 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT1P21579 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT1P21579 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYT1P21579 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT1P21579 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT1P21579 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT1P21579 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT1P21579 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT1P21579 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT1P21579 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT1P21579 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT1P21579 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT1P21579 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT1P21579 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT1P21579 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT1P21579 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT1P21579 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT1P21579 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT1P21579 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT1P21579 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYT1P21579 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT1P21579 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT1P21579 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT1P21579 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT1P21579 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT1P21579 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT1P21579 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT1P21579 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT1P21579 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT1P21579 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT1P21579 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT1P21579 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT1P21579 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYT1P21579 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT1P21579 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT1P21579 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT1P21579 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYT1P21579 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT1P21579 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT1P21579 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT1P21579 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT1P21579 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT1P21579 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT1P21579 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT1P21579 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT1P21579 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT1P21579 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT1P21579 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT1P21579 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT1P21579 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT1P21579 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT1P21579 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYT1P21579 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT1P21579 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT1P21579 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT1P21579 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT1P21579 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYT1P21579 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms