Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD247P20963 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD247P20963 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD247P20963 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD247P20963 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD247P20963 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD247P20963 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD247P20963 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD247P20963 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD247P20963 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD247P20963 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD247P20963 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CD247P20963 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD247P20963 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD247P20963 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD247P20963 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD247P20963 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD247P20963 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD247P20963 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD247P20963 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD247P20963 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD247P20963 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD247P20963 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD247P20963 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD247P20963 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD247P20963 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD247P20963 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD247P20963 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD247P20963 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD247P20963 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD247P20963 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD247P20963 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD247P20963 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CD247P20963 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD247P20963 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD247P20963 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD247P20963 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD247P20963 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CD247P20963 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD247P20963 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD247P20963 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD247P20963 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD247P20963 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD247P20963 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD247P20963 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD247P20963 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD247P20963 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD247P20963 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD247P20963 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD247P20963 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD247P20963 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD247P20963 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD247P20963 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CD247P20963 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD247P20963 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD247P20963 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD247P20963 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD247P20963 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD247P20963 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD247P20963 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD247P20963 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD247P20963 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD247P20963 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD247P20963 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD247P20963 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD247P20963 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CD247P20963 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD247P20963 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD247P20963 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD247P20963 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD247P20963 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD247P20963 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD247P20963 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD247P20963 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD247P20963 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms