Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF1BP20333 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF1BP20333 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms