Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCNA2P20248 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNA2P20248 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNA2P20248 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms