Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-DPA1P20036 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms