Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCAM1P19320 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCAM1P19320 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms