Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD58P19256 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD58P19256 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD58P19256 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD58P19256 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD58P19256 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD58P19256 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD58P19256 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD58P19256 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD58P19256 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD58P19256 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD58P19256 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD58P19256 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD58P19256 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD58P19256 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD58P19256 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD58P19256 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD58P19256 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD58P19256 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD58P19256 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD58P19256 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD58P19256 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CD58P19256 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD58P19256 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD58P19256 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD58P19256 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD58P19256 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD58P19256 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD58P19256 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD58P19256 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CD58P19256 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD58P19256 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD58P19256 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD58P19256 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD58P19256 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD58P19256 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD58P19256 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD58P19256 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD58P19256 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD58P19256 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD58P19256 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CD58P19256 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD58P19256 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD58P19256 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD58P19256 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD58P19256 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD58P19256 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD58P19256 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD58P19256 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD58P19256 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD58P19256 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD58P19256 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD58P19256 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD58P19256 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD58P19256 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD58P19256 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD58P19256 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD58P19256 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD58P19256 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD58P19256 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD58P19256 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD58P19256 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD58P19256 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD58P19256 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD58P19256 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD58P19256 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD58P19256 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD58P19256 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD58P19256 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD58P19256 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD58P19256 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD58P19256 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD58P19256 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD58P19256 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD58P19256 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD58P19256 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD58P19256 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD58P19256 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD58P19256 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD58P19256 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD58P19256 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD58P19256 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD58P19256 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD58P19256 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD58P19256 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD58P19256 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD58P19256 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD58P19256 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD58P19256 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD58P19256 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD58P19256 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CD58P19256 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD58P19256 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD58P19256 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD58P19256 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD58P19256 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD58P19256 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD58P19256 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD58P19256 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD58P19256 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms