Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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PDE6GP18545 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PDE6GP18545 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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