Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCP1P17987 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCP1P17987 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCP1P17987 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCP1P17987 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCP1P17987 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCP1P17987 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCP1P17987 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCP1P17987 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCP1P17987 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCP1P17987 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCP1P17987 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCP1P17987 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCP1P17987 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCP1P17987 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCP1P17987 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCP1P17987 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCP1P17987 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCP1P17987 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCP1P17987 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCP1P17987 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCP1P17987 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCP1P17987 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCP1P17987 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCP1P17987 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCP1P17987 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCP1P17987 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCP1P17987 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCP1P17987 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCP1P17987 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCP1P17987 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCP1P17987 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCP1P17987 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCP1P17987 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCP1P17987 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCP1P17987 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCP1P17987 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCP1P17987 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCP1P17987 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCP1P17987 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCP1P17987 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCP1P17987 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCP1P17987 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCP1P17987 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCP1P17987 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCP1P17987 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCP1P17987 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCP1P17987 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TCP1P17987 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCP1P17987 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCP1P17987 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCP1P17987 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCP1P17987 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCP1P17987 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TCP1P17987 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCP1P17987 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCP1P17987 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCP1P17987 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCP1P17987 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCP1P17987 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCP1P17987 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCP1P17987 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCP1P17987 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCP1P17987 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCP1P17987 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCP1P17987 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCP1P17987 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCP1P17987 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCP1P17987 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCP1P17987 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCP1P17987 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCP1P17987 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCP1P17987 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCP1P17987 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCP1P17987 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCP1P17987 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCP1P17987 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCP1P17987 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCP1P17987 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCP1P17987 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCP1P17987 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCP1P17987 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCP1P17987 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCP1P17987 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCP1P17987 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCP1P17987 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCP1P17987 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCP1P17987 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCP1P17987 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCP1P17987 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCP1P17987 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCP1P17987 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCP1P17987 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCP1P17987 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCP1P17987 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCP1P17987 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCP1P17987 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCP1P17987 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCP1P17987 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCP1P17987 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms