Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPI1P17947 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPI1P17947 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPI1P17947 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPI1P17947 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPI1P17947 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPI1P17947 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPI1P17947 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPI1P17947 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPI1P17947 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPI1P17947 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPI1P17947 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPI1P17947 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPI1P17947 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPI1P17947 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPI1P17947 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPI1P17947 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPI1P17947 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPI1P17947 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPI1P17947 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPI1P17947 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPI1P17947 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPI1P17947 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPI1P17947 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPI1P17947 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPI1P17947 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPI1P17947 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPI1P17947 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPI1P17947 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPI1P17947 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SPI1P17947 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SPI1P17947 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPI1P17947 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPI1P17947 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPI1P17947 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPI1P17947 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPI1P17947 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SPI1P17947 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPI1P17947 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPI1P17947 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPI1P17947 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SPI1P17947 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SPI1P17947 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SPI1P17947 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SPI1P17947 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPI1P17947 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPI1P17947 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPI1P17947 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPI1P17947 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPI1P17947 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPI1P17947 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPI1P17947 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPI1P17947 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPI1P17947 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPI1P17947 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPI1P17947 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPI1P17947 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPI1P17947 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPI1P17947 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPI1P17947 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SPI1P17947 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SPI1P17947 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SPI1P17947 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SPI1P17947 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPI1P17947 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPI1P17947 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPI1P17947 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPI1P17947 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPI1P17947 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPI1P17947 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPI1P17947 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPI1P17947 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPI1P17947 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPI1P17947 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPI1P17947 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPI1P17947 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPI1P17947 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPI1P17947 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPI1P17947 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPI1P17947 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPI1P17947 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPI1P17947 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPI1P17947 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPI1P17947 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPI1P17947 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPI1P17947 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPI1P17947 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPI1P17947 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPI1P17947 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPI1P17947 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPI1P17947 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPI1P17947 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPI1P17947 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPI1P17947 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPI1P17947 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPI1P17947 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPI1P17947 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPI1P17947 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPI1P17947 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPI1P17947 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms