Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN2P17655 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN2P17655 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms