Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE6AP16499 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE6AP16499 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms