Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDGFRAP16234 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDGFRAP16234 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms