Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VEGFAP15692 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VEGFAP15692 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms