Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MYOD1P15172 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms