Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC5A1P13866 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A1P13866 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms