Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT13P13646 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT13P13646 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT13P13646 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT13P13646 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT13P13646 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT13P13646 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT13P13646 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT13P13646 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT13P13646 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT13P13646 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT13P13646 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT13P13646 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT13P13646 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT13P13646 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT13P13646 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT13P13646 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT13P13646 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT13P13646 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT13P13646 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT13P13646 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT13P13646 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT13P13646 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT13P13646 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT13P13646 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT13P13646 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT13P13646 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT13P13646 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT13P13646 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT13P13646 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT13P13646 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT13P13646 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT13P13646 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT13P13646 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT13P13646 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT13P13646 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT13P13646 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT13P13646 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT13P13646 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT13P13646 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT13P13646 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT13P13646 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT13P13646 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT13P13646 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT13P13646 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT13P13646 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT13P13646 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT13P13646 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT13P13646 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT13P13646 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT13P13646 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT13P13646 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT13P13646 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT13P13646 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT13P13646 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT13P13646 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT13P13646 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT13P13646 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT13P13646 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT13P13646 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT13P13646 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT13P13646 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT13P13646 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT13P13646 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT13P13646 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT13P13646 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT13P13646 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT13P13646 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT13P13646 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT13P13646 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT13P13646 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT13P13646 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT13P13646 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT13P13646 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT13P13646 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT13P13646 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT13P13646 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT13P13646 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT13P13646 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT13P13646 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT13P13646 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT13P13646 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT13P13646 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT13P13646 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT13P13646 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT13P13646 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT13P13646 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT13P13646 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT13P13646 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT13P13646 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT13P13646 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT13P13646 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT13P13646 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT13P13646 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT13P13646 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT13P13646 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT13P13646 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT13P13646 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT13P13646 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT13P13646 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms