Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
CFTRP13569 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CFTRP13569 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CFTRP13569 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CFTRP13569 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CFTRP13569 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CFTRP13569 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CFTRP13569 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CFTRP13569 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CFTRP13569 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
CFTRP13569 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CFTRP13569 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
CFTRP13569 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CFTRP13569 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CFTRP13569 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CFTRP13569 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CFTRP13569 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
CFTRP13569 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
CFTRP13569 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
CFTRP13569 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CFTRP13569 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CFTRP13569 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CFTRP13569 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
CFTRP13569 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CFTRP13569 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
CFTRP13569 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CFTRP13569 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CFTRP13569 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CFTRP13569 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
CFTRP13569 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CFTRP13569 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
CFTRP13569 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
CFTRP13569 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CFTRP13569 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
CFTRP13569 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CFTRP13569 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CFTRP13569 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CFTRP13569 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CFTRP13569 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
CFTRP13569 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
CFTRP13569 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CFTRP13569 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
CFTRP13569 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CFTRP13569 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
CFTRP13569 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CFTRP13569 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CFTRP13569 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CFTRP13569 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CFTRP13569 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CFTRP13569 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CFTRP13569 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CFTRP13569 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
CFTRP13569 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CFTRP13569 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CFTRP13569 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CFTRP13569 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CFTRP13569 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CFTRP13569 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CFTRP13569 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CFTRP13569 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CFTRP13569 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CFTRP13569 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CFTRP13569 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CFTRP13569 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
CFTRP13569 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
CFTRP13569 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CFTRP13569 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CFTRP13569 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CFTRP13569 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CFTRP13569 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CFTRP13569 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CFTRP13569 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CFTRP13569 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC37.7■■■■□ 3.62
CFTRP13569 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CFTRP13569 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CFTRP13569 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CFTRP13569 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CFTRP13569 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CFTRP13569 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CFTRP13569 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CFTRP13569 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CFTRP13569 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CFTRP13569 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CFTRP13569 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CFTRP13569 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CFTRP13569 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CFTRP13569 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CFTRP13569 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CFTRP13569 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CFTRP13569 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CFTRP13569 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CFTRP13569 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CFTRP13569 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
CFTRP13569 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CFTRP13569 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
CFTRP13569 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CFTRP13569 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CFTRP13569 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CFTRP13569 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CFTRP13569 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms