Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RLBP1P12271 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RLBP1P12271 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RLBP1P12271 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RLBP1P12271 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RLBP1P12271 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RLBP1P12271 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RLBP1P12271 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RLBP1P12271 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RLBP1P12271 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RLBP1P12271 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RLBP1P12271 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RLBP1P12271 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RLBP1P12271 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RLBP1P12271 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RLBP1P12271 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RLBP1P12271 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RLBP1P12271 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RLBP1P12271 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RLBP1P12271 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RLBP1P12271 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RLBP1P12271 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RLBP1P12271 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RLBP1P12271 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RLBP1P12271 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RLBP1P12271 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RLBP1P12271 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RLBP1P12271 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RLBP1P12271 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RLBP1P12271 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RLBP1P12271 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RLBP1P12271 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RLBP1P12271 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RLBP1P12271 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RLBP1P12271 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RLBP1P12271 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RLBP1P12271 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RLBP1P12271 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RLBP1P12271 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RLBP1P12271 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RLBP1P12271 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RLBP1P12271 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RLBP1P12271 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RLBP1P12271 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RLBP1P12271 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RLBP1P12271 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RLBP1P12271 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RLBP1P12271 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RLBP1P12271 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RLBP1P12271 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RLBP1P12271 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RLBP1P12271 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RLBP1P12271 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RLBP1P12271 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RLBP1P12271 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RLBP1P12271 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RLBP1P12271 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RLBP1P12271 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RLBP1P12271 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RLBP1P12271 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RLBP1P12271 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RLBP1P12271 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RLBP1P12271 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RLBP1P12271 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms