Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL6A2P12110 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL6A2P12110 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms