Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PYGBP11216 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PYGBP11216 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PYGBP11216 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PYGBP11216 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PYGBP11216 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PYGBP11216 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PYGBP11216 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PYGBP11216 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PYGBP11216 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PYGBP11216 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PYGBP11216 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYGBP11216 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYGBP11216 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYGBP11216 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PYGBP11216 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYGBP11216 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYGBP11216 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYGBP11216 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYGBP11216 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PYGBP11216 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYGBP11216 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PYGBP11216 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYGBP11216 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYGBP11216 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYGBP11216 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYGBP11216 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYGBP11216 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYGBP11216 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYGBP11216 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYGBP11216 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYGBP11216 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYGBP11216 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYGBP11216 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYGBP11216 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYGBP11216 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PYGBP11216 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGBP11216 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGBP11216 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGBP11216 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGBP11216 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGBP11216 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGBP11216 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGBP11216 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGBP11216 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGBP11216 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGBP11216 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGBP11216 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGBP11216 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGBP11216 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGBP11216 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGBP11216 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGBP11216 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGBP11216 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PYGBP11216 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYGBP11216 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYGBP11216 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYGBP11216 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYGBP11216 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYGBP11216 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYGBP11216 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYGBP11216 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PYGBP11216 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYGBP11216 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYGBP11216 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYGBP11216 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYGBP11216 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PYGBP11216 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PYGBP11216 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYGBP11216 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYGBP11216 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYGBP11216 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYGBP11216 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYGBP11216 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYGBP11216 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYGBP11216 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYGBP11216 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYGBP11216 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYGBP11216 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYGBP11216 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYGBP11216 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYGBP11216 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PYGBP11216 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PYGBP11216 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYGBP11216 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYGBP11216 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYGBP11216 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYGBP11216 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYGBP11216 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYGBP11216 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYGBP11216 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYGBP11216 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYGBP11216 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYGBP11216 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYGBP11216 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PYGBP11216 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PYGBP11216 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PYGBP11216 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PYGBP11216 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PYGBP11216 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms