Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP3P10745 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP3P10745 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP3P10745 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP3P10745 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP3P10745 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP3P10745 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP3P10745 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP3P10745 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP3P10745 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP3P10745 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP3P10745 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBP3P10745 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP3P10745 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP3P10745 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP3P10745 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP3P10745 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP3P10745 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP3P10745 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP3P10745 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP3P10745 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP3P10745 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP3P10745 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP3P10745 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP3P10745 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP3P10745 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP3P10745 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP3P10745 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP3P10745 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP3P10745 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP3P10745 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP3P10745 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP3P10745 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP3P10745 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBP3P10745 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBP3P10745 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP3P10745 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP3P10745 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP3P10745 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP3P10745 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP3P10745 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP3P10745 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP3P10745 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP3P10745 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP3P10745 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP3P10745 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP3P10745 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP3P10745 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP3P10745 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP3P10745 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP3P10745 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP3P10745 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP3P10745 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP3P10745 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP3P10745 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP3P10745 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP3P10745 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP3P10745 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP3P10745 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP3P10745 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP3P10745 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP3P10745 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP3P10745 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP3P10745 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP3P10745 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP3P10745 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP3P10745 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP3P10745 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP3P10745 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP3P10745 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP3P10745 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP3P10745 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP3P10745 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP3P10745 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP3P10745 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP3P10745 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP3P10745 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP3P10745 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP3P10745 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP3P10745 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP3P10745 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP3P10745 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP3P10745 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP3P10745 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP3P10745 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP3P10745 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP3P10745 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP3P10745 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP3P10745 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP3P10745 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP3P10745 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP3P10745 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP3P10745 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP3P10745 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP3P10745 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP3P10745 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP3P10745 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP3P10745 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP3P10745 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP3P10745 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms