Protein–RNA interactions for Protein: P0DMU3

FAM231A/C-like protein LOC102723383, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0DMU3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P0DMU3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P0DMU3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P0DMU3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P0DMU3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P0DMU3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P0DMU3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P0DMU3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P0DMU3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P0DMU3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P0DMU3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P0DMU3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P0DMU3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P0DMU3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P0DMU3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P0DMU3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P0DMU3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P0DMU3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P0DMU3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P0DMU3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P0DMU3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P0DMU3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P0DMU3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P0DMU3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P0DMU3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P0DMU3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P0DMU3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P0DMU3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P0DMU3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P0DMU3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P0DMU3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P0DMU3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P0DMU3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P0DMU3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P0DMU3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P0DMU3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P0DMU3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P0DMU3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P0DMU3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P0DMU3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P0DMU3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P0DMU3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P0DMU3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
P0DMU3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P0DMU3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P0DMU3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P0DMU3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P0DMU3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P0DMU3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P0DMU3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P0DMU3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P0DMU3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P0DMU3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P0DMU3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P0DMU3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P0DMU3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P0DMU3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P0DMU3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P0DMU3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P0DMU3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P0DMU3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P0DMU3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P0DMU3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P0DMU3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P0DMU3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P0DMU3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P0DMU3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
P0DMU3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P0DMU3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P0DMU3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P0DMU3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P0DMU3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P0DMU3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P0DMU3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P0DMU3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P0DMU3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P0DMU3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P0DMU3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms