Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM200BP0CF97 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM200BP0CF97 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms