Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
HOXB7P09629 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXB7P09629 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms