Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP3P08254 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP3P08254 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP3P08254 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP3P08254 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP3P08254 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP3P08254 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP3P08254 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP3P08254 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP3P08254 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP3P08254 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP3P08254 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP3P08254 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP3P08254 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP3P08254 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP3P08254 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MMP3P08254 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP3P08254 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP3P08254 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP3P08254 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP3P08254 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP3P08254 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP3P08254 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP3P08254 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP3P08254 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP3P08254 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP3P08254 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP3P08254 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP3P08254 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP3P08254 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP3P08254 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP3P08254 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP3P08254 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP3P08254 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP3P08254 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP3P08254 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP3P08254 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP3P08254 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP3P08254 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP3P08254 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP3P08254 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP3P08254 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP3P08254 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP3P08254 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP3P08254 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP3P08254 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP3P08254 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP3P08254 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP3P08254 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP3P08254 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP3P08254 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP3P08254 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP3P08254 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP3P08254 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP3P08254 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP3P08254 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP3P08254 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP3P08254 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP3P08254 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP3P08254 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP3P08254 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP3P08254 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP3P08254 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP3P08254 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP3P08254 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP3P08254 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP3P08254 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP3P08254 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP3P08254 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP3P08254 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP3P08254 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP3P08254 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP3P08254 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP3P08254 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP3P08254 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP3P08254 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP3P08254 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP3P08254 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP3P08254 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP3P08254 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP3P08254 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP3P08254 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP3P08254 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMP3P08254 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP3P08254 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP3P08254 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP3P08254 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP3P08254 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP3P08254 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP3P08254 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP3P08254 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP3P08254 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP3P08254 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP3P08254 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP3P08254 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP3P08254 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP3P08254 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP3P08254 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP3P08254 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP3P08254 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms