Protein–RNA interactions for Protein: P07357

C8A, Complement component C8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8AP07357 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8AP07357 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8AP07357 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8AP07357 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8AP07357 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8AP07357 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8AP07357 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8AP07357 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8AP07357 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8AP07357 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C8AP07357 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C8AP07357 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8AP07357 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8AP07357 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8AP07357 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8AP07357 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8AP07357 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8AP07357 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8AP07357 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8AP07357 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8AP07357 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8AP07357 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8AP07357 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8AP07357 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8AP07357 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8AP07357 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8AP07357 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8AP07357 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8AP07357 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8AP07357 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8AP07357 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8AP07357 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8AP07357 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8AP07357 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C8AP07357 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C8AP07357 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8AP07357 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8AP07357 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8AP07357 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8AP07357 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8AP07357 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8AP07357 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8AP07357 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8AP07357 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8AP07357 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8AP07357 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C8AP07357 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8AP07357 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8AP07357 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8AP07357 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8AP07357 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8AP07357 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8AP07357 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8AP07357 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8AP07357 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8AP07357 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8AP07357 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8AP07357 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8AP07357 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8AP07357 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C8AP07357 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8AP07357 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8AP07357 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8AP07357 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8AP07357 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8AP07357 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8AP07357 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8AP07357 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8AP07357 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8AP07357 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8AP07357 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8AP07357 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8AP07357 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8AP07357 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8AP07357 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8AP07357 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8AP07357 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8AP07357 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C8AP07357 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8AP07357 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8AP07357 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8AP07357 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8AP07357 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C8AP07357 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8AP07357 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8AP07357 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8AP07357 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8AP07357 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C8AP07357 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8AP07357 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8AP07357 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8AP07357 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8AP07357 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C8AP07357 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8AP07357 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8AP07357 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8AP07357 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8AP07357 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8AP07357 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8AP07357 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms