Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSF1RP07333 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF1RP07333 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms