Protein–RNA interactions for Protein: P05783

KRT18, Keratin, type I cytoskeletal 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P05783 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT18P05783 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT18P05783 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT18P05783 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT18P05783 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT18P05783 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT18P05783 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT18P05783 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT18P05783 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT18P05783 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT18P05783 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT18P05783 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT18P05783 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT18P05783 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT18P05783 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT18P05783 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT18P05783 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT18P05783 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT18P05783 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT18P05783 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT18P05783 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT18P05783 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT18P05783 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT18P05783 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT18P05783 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT18P05783 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT18P05783 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT18P05783 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT18P05783 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT18P05783 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT18P05783 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT18P05783 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT18P05783 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT18P05783 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT18P05783 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT18P05783 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT18P05783 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT18P05783 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT18P05783 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT18P05783 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT18P05783 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT18P05783 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT18P05783 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT18P05783 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT18P05783 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT18P05783 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT18P05783 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT18P05783 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT18P05783 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT18P05783 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT18P05783 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT18P05783 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT18P05783 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT18P05783 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT18P05783 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT18P05783 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT18P05783 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT18P05783 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT18P05783 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT18P05783 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT18P05783 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT18P05783 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT18P05783 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT18P05783 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT18P05783 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT18P05783 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT18P05783 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT18P05783 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT18P05783 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT18P05783 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT18P05783 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT18P05783 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT18P05783 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT18P05783 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT18P05783 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT18P05783 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT18P05783 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT18P05783 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT18P05783 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT18P05783 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT18P05783 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT18P05783 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT18P05783 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT18P05783 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT18P05783 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT18P05783 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT18P05783 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT18P05783 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT18P05783 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT18P05783 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT18P05783 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT18P05783 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT18P05783 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT18P05783 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT18P05783 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT18P05783 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT18P05783 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT18P05783 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT18P05783 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT18P05783 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms