Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRM2P04554 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRM2P04554 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRM2P04554 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRM2P04554 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRM2P04554 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRM2P04554 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRM2P04554 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRM2P04554 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRM2P04554 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRM2P04554 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRM2P04554 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRM2P04554 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRM2P04554 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRM2P04554 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRM2P04554 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRM2P04554 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRM2P04554 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRM2P04554 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRM2P04554 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRM2P04554 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRM2P04554 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRM2P04554 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRM2P04554 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRM2P04554 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRM2P04554 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRM2P04554 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PRM2P04554 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRM2P04554 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRM2P04554 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRM2P04554 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRM2P04554 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRM2P04554 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRM2P04554 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PRM2P04554 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRM2P04554 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRM2P04554 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRM2P04554 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRM2P04554 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRM2P04554 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRM2P04554 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRM2P04554 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRM2P04554 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRM2P04554 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRM2P04554 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PRM2P04554 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRM2P04554 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRM2P04554 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRM2P04554 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRM2P04554 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PRM2P04554 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PRM2P04554 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRM2P04554 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRM2P04554 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRM2P04554 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRM2P04554 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRM2P04554 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRM2P04554 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRM2P04554 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRM2P04554 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRM2P04554 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRM2P04554 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRM2P04554 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRM2P04554 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRM2P04554 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRM2P04554 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRM2P04554 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRM2P04554 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRM2P04554 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRM2P04554 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRM2P04554 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRM2P04554 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRM2P04554 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRM2P04554 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRM2P04554 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRM2P04554 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRM2P04554 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRM2P04554 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms