Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNAP02545 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNAP02545 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNAP02545 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNAP02545 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNAP02545 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNAP02545 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMNAP02545 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNAP02545 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNAP02545 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNAP02545 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNAP02545 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNAP02545 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNAP02545 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNAP02545 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNAP02545 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNAP02545 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNAP02545 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNAP02545 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LMNAP02545 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNAP02545 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNAP02545 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNAP02545 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNAP02545 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNAP02545 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNAP02545 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNAP02545 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNAP02545 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNAP02545 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNAP02545 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNAP02545 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNAP02545 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNAP02545 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNAP02545 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNAP02545 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNAP02545 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNAP02545 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNAP02545 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNAP02545 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNAP02545 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMNAP02545 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNAP02545 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNAP02545 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNAP02545 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNAP02545 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNAP02545 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNAP02545 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNAP02545 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNAP02545 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNAP02545 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNAP02545 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNAP02545 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNAP02545 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNAP02545 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNAP02545 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNAP02545 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNAP02545 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMNAP02545 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNAP02545 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNAP02545 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNAP02545 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNAP02545 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNAP02545 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNAP02545 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNAP02545 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNAP02545 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNAP02545 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LMNAP02545 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LMNAP02545 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LMNAP02545 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LMNAP02545 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNAP02545 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNAP02545 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNAP02545 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNAP02545 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNAP02545 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNAP02545 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNAP02545 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNAP02545 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNAP02545 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNAP02545 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMNAP02545 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNAP02545 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNAP02545 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNAP02545 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNAP02545 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNAP02545 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNAP02545 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNAP02545 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNAP02545 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNAP02545 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNAP02545 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNAP02545 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNAP02545 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMNAP02545 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNAP02545 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNAP02545 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNAP02545 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNAP02545 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNAP02545 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms