Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL4A1P02462 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
COL4A1P02462 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A1P02462 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A1P02462 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A1P02462 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A1P02462 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A1P02462 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A1P02462 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A1P02462 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A1P02462 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A1P02462 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A1P02462 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A1P02462 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL4A1P02462 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL4A1P02462 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL4A1P02462 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL4A1P02462 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms