Protein–RNA interactions for Protein: O95427

PIGN, GPI ethanolamine phosphate transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGNO95427 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGNO95427 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGNO95427 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGNO95427 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGNO95427 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGNO95427 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGNO95427 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIGNO95427 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGNO95427 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGNO95427 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGNO95427 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGNO95427 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGNO95427 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGNO95427 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGNO95427 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGNO95427 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGNO95427 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIGNO95427 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIGNO95427 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIGNO95427 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIGNO95427 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIGNO95427 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIGNO95427 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIGNO95427 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGNO95427 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGNO95427 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGNO95427 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGNO95427 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGNO95427 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGNO95427 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGNO95427 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGNO95427 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGNO95427 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGNO95427 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIGNO95427 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGNO95427 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGNO95427 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGNO95427 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGNO95427 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGNO95427 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGNO95427 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGNO95427 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGNO95427 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGNO95427 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGNO95427 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGNO95427 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGNO95427 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGNO95427 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PIGNO95427 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGNO95427 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGNO95427 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGNO95427 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGNO95427 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGNO95427 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGNO95427 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGNO95427 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIGNO95427 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGNO95427 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGNO95427 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGNO95427 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGNO95427 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGNO95427 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGNO95427 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGNO95427 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGNO95427 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGNO95427 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGNO95427 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGNO95427 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGNO95427 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIGNO95427 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGNO95427 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGNO95427 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGNO95427 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGNO95427 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGNO95427 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGNO95427 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGNO95427 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGNO95427 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGNO95427 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGNO95427 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGNO95427 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGNO95427 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGNO95427 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGNO95427 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGNO95427 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGNO95427 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGNO95427 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIGNO95427 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGNO95427 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGNO95427 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGNO95427 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGNO95427 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGNO95427 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGNO95427 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGNO95427 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGNO95427 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGNO95427 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGNO95427 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGNO95427 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIGNO95427 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms