Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNDBP1O95273 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNDBP1O95273 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms