Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB3O75712 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB3O75712 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB3O75712 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB3O75712 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB3O75712 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB3O75712 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB3O75712 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB3O75712 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB3O75712 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB3O75712 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB3O75712 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB3O75712 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB3O75712 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB3O75712 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB3O75712 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB3O75712 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB3O75712 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB3O75712 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB3O75712 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB3O75712 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB3O75712 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB3O75712 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB3O75712 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB3O75712 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB3O75712 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB3O75712 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB3O75712 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB3O75712 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB3O75712 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB3O75712 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB3O75712 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB3O75712 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB3O75712 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB3O75712 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB3O75712 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB3O75712 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB3O75712 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB3O75712 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB3O75712 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB3O75712 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB3O75712 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB3O75712 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB3O75712 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB3O75712 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB3O75712 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB3O75712 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB3O75712 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB3O75712 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB3O75712 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB3O75712 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB3O75712 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB3O75712 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB3O75712 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB3O75712 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB3O75712 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB3O75712 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB3O75712 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB3O75712 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB3O75712 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB3O75712 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB3O75712 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB3O75712 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB3O75712 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB3O75712 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB3O75712 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB3O75712 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB3O75712 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB3O75712 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB3O75712 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB3O75712 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB3O75712 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB3O75712 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB3O75712 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB3O75712 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB3O75712 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB3O75712 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJB3O75712 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB3O75712 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB3O75712 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB3O75712 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB3O75712 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB3O75712 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB3O75712 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB3O75712 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB3O75712 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB3O75712 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB3O75712 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB3O75712 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB3O75712 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJB3O75712 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB3O75712 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB3O75712 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB3O75712 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB3O75712 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB3O75712 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB3O75712 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB3O75712 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB3O75712 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJB3O75712 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms