Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KA4O75676 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms