Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GPC4O75487 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPC4O75487 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC4O75487 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC4O75487 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC4O75487 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC4O75487 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC4O75487 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC4O75487 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC4O75487 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC4O75487 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC4O75487 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC4O75487 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC4O75487 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC4O75487 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC4O75487 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC4O75487 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC4O75487 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC4O75487 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC4O75487 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC4O75487 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC4O75487 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC4O75487 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC4O75487 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC4O75487 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC4O75487 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC4O75487 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC4O75487 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC4O75487 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC4O75487 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC4O75487 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC4O75487 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC4O75487 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC4O75487 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC4O75487 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC4O75487 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC4O75487 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC4O75487 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC4O75487 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC4O75487 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC4O75487 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC4O75487 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC4O75487 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC4O75487 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC4O75487 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC4O75487 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC4O75487 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC4O75487 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC4O75487 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC4O75487 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC4O75487 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC4O75487 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC4O75487 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC4O75487 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC4O75487 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC4O75487 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC4O75487 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC4O75487 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC4O75487 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC4O75487 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC4O75487 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC4O75487 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC4O75487 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC4O75487 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC4O75487 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC4O75487 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC4O75487 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC4O75487 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC4O75487 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC4O75487 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC4O75487 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC4O75487 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC4O75487 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC4O75487 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC4O75487 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC4O75487 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC4O75487 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC4O75487 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC4O75487 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC4O75487 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC4O75487 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC4O75487 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC4O75487 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC4O75487 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC4O75487 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC4O75487 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC4O75487 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC4O75487 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC4O75487 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC4O75487 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC4O75487 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC4O75487 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC4O75487 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC4O75487 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC4O75487 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC4O75487 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC4O75487 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC4O75487 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC4O75487 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC4O75487 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms