Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMPCBO75439 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PMPCBO75439 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms