Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP12O75317 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP12O75317 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP12O75317 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP12O75317 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP12O75317 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP12O75317 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP12O75317 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP12O75317 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP12O75317 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP12O75317 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP12O75317 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP12O75317 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP12O75317 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP12O75317 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP12O75317 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP12O75317 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP12O75317 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP12O75317 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP12O75317 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP12O75317 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP12O75317 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP12O75317 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP12O75317 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP12O75317 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP12O75317 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP12O75317 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP12O75317 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP12O75317 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP12O75317 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP12O75317 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP12O75317 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP12O75317 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP12O75317 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP12O75317 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP12O75317 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP12O75317 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP12O75317 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP12O75317 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP12O75317 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP12O75317 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP12O75317 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP12O75317 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP12O75317 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP12O75317 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP12O75317 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP12O75317 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP12O75317 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP12O75317 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP12O75317 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP12O75317 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP12O75317 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP12O75317 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP12O75317 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP12O75317 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP12O75317 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP12O75317 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP12O75317 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP12O75317 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP12O75317 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP12O75317 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP12O75317 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP12O75317 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP12O75317 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP12O75317 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP12O75317 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP12O75317 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP12O75317 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP12O75317 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP12O75317 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP12O75317 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP12O75317 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP12O75317 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP12O75317 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP12O75317 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP12O75317 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP12O75317 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP12O75317 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP12O75317 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP12O75317 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP12O75317 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP12O75317 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP12O75317 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP12O75317 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP12O75317 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP12O75317 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP12O75317 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP12O75317 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP12O75317 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP12O75317 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP12O75317 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP12O75317 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP12O75317 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP12O75317 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP12O75317 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP12O75317 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP12O75317 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP12O75317 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP12O75317 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP12O75317 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms