Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC43.95■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC43.95■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC43.95■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC43.94■■■■■ 4.63
ABCC9O60706 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC43.94■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC43.94■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC43.93■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC43.92■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC43.92■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC43.91■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.9■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC43.9■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.9■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.89■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC43.89■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC43.89■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
ABCC9O60706 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC43.88■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC43.87■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC43.86■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC43.85■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC43.84■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC43.84■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC43.83■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
ABCC9O60706 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms