Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD2O60548 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD2O60548 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD2O60548 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD2O60548 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD2O60548 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD2O60548 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD2O60548 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD2O60548 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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