Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF9O60383 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF9O60383 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF9O60383 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF9O60383 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF9O60383 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF9O60383 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF9O60383 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF9O60383 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF9O60383 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF9O60383 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF9O60383 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF9O60383 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF9O60383 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GDF9O60383 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF9O60383 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF9O60383 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF9O60383 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF9O60383 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF9O60383 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF9O60383 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF9O60383 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF9O60383 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF9O60383 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF9O60383 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF9O60383 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF9O60383 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF9O60383 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF9O60383 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF9O60383 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF9O60383 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF9O60383 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF9O60383 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF9O60383 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF9O60383 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF9O60383 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF9O60383 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF9O60383 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF9O60383 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF9O60383 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF9O60383 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF9O60383 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF9O60383 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF9O60383 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF9O60383 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF9O60383 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF9O60383 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF9O60383 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF9O60383 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF9O60383 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF9O60383 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF9O60383 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF9O60383 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF9O60383 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GDF9O60383 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF9O60383 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF9O60383 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF9O60383 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF9O60383 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GDF9O60383 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GDF9O60383 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF9O60383 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF9O60383 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDF9O60383 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDF9O60383 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF9O60383 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF9O60383 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF9O60383 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF9O60383 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF9O60383 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF9O60383 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF9O60383 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF9O60383 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF9O60383 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF9O60383 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF9O60383 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF9O60383 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GDF9O60383 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF9O60383 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF9O60383 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDF9O60383 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDF9O60383 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF9O60383 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF9O60383 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF9O60383 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF9O60383 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF9O60383 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF9O60383 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF9O60383 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF9O60383 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF9O60383 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF9O60383 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDF9O60383 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF9O60383 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GDF9O60383 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDF9O60383 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GDF9O60383 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GDF9O60383 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF9O60383 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDF9O60383 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms