Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CACNG3O60359 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG3O60359 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms