Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNIP3LO60238 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNIP3LO60238 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms