Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RRP9O43818 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP9O43818 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP9O43818 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP9O43818 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP9O43818 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP9O43818 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP9O43818 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP9O43818 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP9O43818 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP9O43818 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP9O43818 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP9O43818 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP9O43818 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP9O43818 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP9O43818 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RRP9O43818 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RRP9O43818 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RRP9O43818 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RRP9O43818 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RRP9O43818 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RRP9O43818 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP9O43818 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP9O43818 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP9O43818 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP9O43818 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP9O43818 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP9O43818 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP9O43818 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP9O43818 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP9O43818 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP9O43818 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP9O43818 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP9O43818 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP9O43818 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP9O43818 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP9O43818 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP9O43818 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP9O43818 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP9O43818 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP9O43818 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP9O43818 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP9O43818 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP9O43818 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP9O43818 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP9O43818 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP9O43818 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP9O43818 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP9O43818 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP9O43818 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP9O43818 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP9O43818 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP9O43818 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP9O43818 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP9O43818 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP9O43818 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP9O43818 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP9O43818 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP9O43818 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP9O43818 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP9O43818 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP9O43818 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP9O43818 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP9O43818 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP9O43818 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP9O43818 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP9O43818 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP9O43818 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP9O43818 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP9O43818 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP9O43818 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP9O43818 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP9O43818 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP9O43818 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP9O43818 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP9O43818 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP9O43818 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP9O43818 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP9O43818 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP9O43818 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP9O43818 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP9O43818 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP9O43818 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP9O43818 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP9O43818 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP9O43818 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP9O43818 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP9O43818 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP9O43818 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP9O43818 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRP9O43818 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP9O43818 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP9O43818 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP9O43818 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP9O43818 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP9O43818 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP9O43818 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP9O43818 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP9O43818 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRP9O43818 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms