Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSNA1O43805 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSNA1O43805 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSNA1O43805 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSNA1O43805 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSNA1O43805 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSNA1O43805 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSNA1O43805 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSNA1O43805 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSNA1O43805 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSNA1O43805 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSNA1O43805 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSNA1O43805 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSNA1O43805 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSNA1O43805 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSNA1O43805 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSNA1O43805 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSNA1O43805 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms