Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKAB2O43741 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms