Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
HTATSF1O43719 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1O43719 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms