Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMAD6O43541 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD6O43541 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms