Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KCNQ2O43526 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNQ2O43526 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms